雖然目前大型實驗仍未證實益生菌對腸道問題的改善，但許多小型實驗紛紛指證使用益生菌的好處，辜且不論大型研究的結果，益生菌在市面上的使用，已行之有年，但在產品的選擇上，大家往往一頭霧水。何況電視廣告的腸道益生菌百百種，如何挑選自己適合的益生菌，真的要做一番功能，才能區別的出來。微笑藥師網在此列出常見腸道益生菌，供大家參考選擇：
一、市面上常見的腸道益生菌
1.若元胃腸錠（膚色包裝）
主成分：米麴菌（含有6種消化酵素）、啤酒酵母粉末（綜合營養素）、乳酸菌（糞鏈球菌）
特色：同時具有「幫助消化」、「整腸」、「營養」的功能，適合現代高壓力飲食不均衡者（補充營養）及消化不良（消化酵素）、易脹氣者。
缺點：成人每次須服用9錠，使用上較為不便。菌數含量較低，整腸效果較不明顯。
2.若元整腸錠（白色包裝）
主成分：為比菲德氏菌叢（龍根菌B. longum與比菲德氏菌B. bifidum）、嗜酸乳酸桿菌（L. acidophilus）
- 龍根菌與比非德氏菌，為成人/小孩「大腸」中，容易定殖的菌種，產生乳酸與醋酸抑制壞菌的增生。
- 嗜酸乳桿菌，長駐在「小腸」中，分泌乳酸與醋酸，抑制壞菌。
特色：特選兩種容易定殖在大小、小孩腸道的菌種，降低壞菌滋生。適合易脹，腸道功能不佳者，緩解輕度腹瀉/便泌作用。
比較：與「若元胃腸錠」相比，「整腸錠」強化在腸道益生菌的定殖，但少了「胃腸錠」的消化酵素與啤酒酵母。
3.若元整腸粉
主成分：為「抗生物質耐性乳酸菌」（每公克含18毫克，相當於9*109個菌數=90億），主要為嗜酸乳桿菌（L. acidophilus）、比菲德氏菌叢、糞鏈球菌（S. faecalis）
- 嗜酸乳桿菌/比菲德氏菌，分別定殖於小腸/大腸，抑制壞菌增生
- 糞鏈球菌，主要分佈於小腸，繁殖力強，增殖快且生存期間久；能幫助嗜酸乳桿菌（L. acidophilus）及比菲德氏菌加速發育。
特色：對抗生素/化療製劑較有耐受性，適合用在減少服用抗生素產生的腸道副作用。菌數含量足夠，能發揮腸道定殖的作用。常見小兒感冒服用抗生素造成腹瀉、感冒造成腸道問題等急慢性狀況使用。
4.欣表飛鳴錠
主成分：為比菲德氏菌（B. bifidum）、糞鏈球菌（S. faecalis）、嗜酸乳桿菌（L. acidophilus）
- 配方組成與「若元養腸粉」相同。菌株不易受到胃酸的影響，以活性的狀態到達腸內。
特色：含3種醫療級A（嗜酸乳桿菌）、B（比菲德氏菌）、F活性乳酸菌（糞鏈球菌），快速建立健康菌叢。有F菌的快速作用，又有A、B菌的續航力。
比較：與「若元整腸錠」相比，理論上，欣表飛鳴錠菌株定殖效果會較佳。
5.表飛鳴-樂散
主成分：為「耐性乳酸菌」（每公克含6毫克），主要菌株為糞鏈球菌（S. facalis）
特色：對抗生素/化療製劑較有耐受性，適合用在減少服用抗生素產生的腸道副作用。
比較：與「若元整腸粉」相比，若元整腸粉的共生菌配方，在續航力在佳。若腸道問題持續一週以上，使用「若元整腸粉」可能較適合。
6.康貝兒
主成分：為10種乳酸菌：乳酸球菌（E. faecalis）、嗜酸乳桿菌（L. acidophilus）、雙叉桿菌（B. bididum）、乾酪乳桿菌（L. casei）、腸球菌（Enterococcus faecium）、乳桿R菌（L. reuteri）、產孢乳酸菌S（S. inulins）、長雙叉桿菌（B. longum）、LGG菌（L. rhamnosum）、短雙歧乳桿菌（B. breve）
- 雙歧乳酸菌：其特殊結構，可以卡腸道。其所產生的醋酸及乳酸等有機酸能促進胃排空，增進腸道蠕動，提高糞便中水分含量，改善腹瀉便泌。長期服用，有助腸道蠕動與頻率。
- 每小包含1.5克菌株粉末（約1500億菌數）
特色：含10種功能不同的乳酸菌，在小/大腸發揮保護作用
缺點：10種益菌是否能在腸道發揮共生系統（互相競爭）；腸道定殖菌數空間有限，20-100億菌數為宜，高單位含量是否影響益生菌的定殖作用（相互卡位），值得民眾好好思考！
7.DDS-1（60億/120億/220億）
主成分：為嗜酸性乳酸桿菌（L. acidphilus）、比菲德氏菌（B. bifidum ） ，市面上有每公克30/60/120/220億菌的產品。
比較：DDS-1等同於「若元整腸錠」的菌株含量升級版。產品呈粉末，含活性菌株比例較「若元整腸錠」高。（製錠過程高壓高溫，活性菌株比例會下降）。
8.阿德比
主成分：為乾酪乳酸桿菌（Lactobacillus casei），每克含8*108的菌株，每粒膠囊含250mg。
- 腸內定殖力最強的乳酸菌，可在腸道內存活15天以上，主要宣稱為預防腸道不適症狀、提昇免疫力使腸道菌叢正常化和抑制過敏物質釋放。
特色：菌種腸道定殖性強，甚至不一定要每天吃，也可以維持效果。
缺點：針對乳糖不耐、或因感冒使用抗生素而造成的喝奶腹耐，效果不佳。選用比菲雙歧桿菌類的產品，效果應該較好。
9.日本味王-消化加強S錠
主成分：為酵母、木瓜酵素、鳳梨酵素、AES綜合酵素（Protease、Lipase、Amylase、Celluase）、嗜酸乳桿菌（L. acidophilus）、比菲德氏菌叢（龍根菌B. longum與比菲德氏菌B. bifidum）、芽孢納豆菌（Bacillus subtilis），每2錠菌數約為5*1010=500億
- 木瓜酵素（Papain）+鳳梨酵素（Bromelain）：能幫助消化蛋白質、醣類、脂肪，尤其針對愛吃紅肉的族群。另外鳳梨酵素有抗發炎的作用。
- 芽孢納豆菌：能耐熱45-55度，穩定且活久時間久。
- AES綜合酵孝：能耐酸鹼PH1.5-11。
特色：結合「若元胃腸錠」與「若元整腸錠」，同時整腸、營養、消化。此產品優化在消化部分，整腸的菌株與「若元整腸錠」相似，而BS菌的特色不明顯，適合於平時保養用，慢性腸炎者。
10.妙利散（Miyarisan BM）
主成分：為Clostridium Butyricum Miyairi 588（一種耐酸、耐熱，不受抗生素影響的G（+），偏性厭氧菌）。一包1gm含CBM約3.8~5.0×108，相當於5億菌株。
- 妙利散Miyarisan BM口服後約30 分鐘內即進入小腸上部及中部，分泌出Butyricacid 之人體所需短鏈脂肪酸，在腸道上皮細胞抑制壞菌，潛在致病菌株繁殖及抑制病原菌毒素之產生。同時產生葡萄糖、麥芽糖、Vit B 及Oligo 可促進腸道內A、B 菌（有益菌）之繁殖。
- 臨床應用在使用抗生素引起的腹瀉、腸躁症（IBS）、幽門桿菌輔助治療，便泌。
二、益生菌-菌種的比較
市面上益生菌產品百百種，但說穿了，主要代表性的益生菌就這幾隻，在此列出供大家比較選擇。或許下次當您須要選購益生菌時，除了聽販售者介紹外，自己也有獨立判斷的能力。抑或在選購時，將這些比較印下來，去現場比對一番！
益生菌的使用，以乳酸菌為主，其為能利用碳水化合物進行發酵生產多量乳酸之細菌，常見乳酸菌介紹如下：
A菌：嗜乳酸桿菌（Lactobacillus acidophilus），長駐於小腸，分泌乳酸與醋酸抑制壞菌入侵。主要功能為增強免疫力、使腸道菌叢正常化和抑制陰道黴菌生長，代表性產品為表飛鳴。針對陰道預防感染的保健，建議日常多補充「蔓越莓錠」及此類益生菌；若是更年期婦女族群，請注意女性荷爾蒙低下的問題，才能有效改善。
B菌：比菲德氏菌（Bifidobacterium species），也稱雙歧桿菌，多定殖於大腸。較常見菌種為Lactobacillus bifidum，其他還有雷特斯菌（B. lactis）或龍根菌（B. longum），具耐酸、耐膽汁、耐氧等特性，主要功能為使腸道菌叢正常化及有助於病毒性腹瀉的改善。
此類菌株最大的特色在於雙歧結構，能有效卡在腸道表面構成保護膜，所以對於腸道防護作用佳，例如防止旅行時水土不服引發的腹瀉。針對乳糖不耐（先天或服用抗生素引起）者，選用配方上，建議選用「嗜熱鏈球菌（Streptococcus thermophilus）」+「保加利亞乳酸菌（L. bulgaricus）」+A、B菌為宜，原因在於前二類菌珠能快速分解乳糖成酸，並幫助A、B菌的定殖生長。
C菌：凱氏乳酸菌（Lactobacillus casei）是腸內定殖力最強的乳酸菌，可在腸道內存活15天以上，主要宣稱為預防腸道不適症狀、提昇免疫力使腸道菌叢正常化和抑制過敏物質釋放，代表性產品為阿德比膠囊。
LP菌：副凱氏乳酸桿菌（Lactobacillus paracasei），代表性產品為統一LP33機能性優酪乳。國內研究號稱可以抗過敏，分泌高濃度γ干擾素，來減低過敏發炎反應。市面上強調過敏配方的產品，大多含有LP菌與LGG菌（異位性皮膚炎），在考慮益生菌發揮作用前，須考慮菌株定殖的問題，所以在選用「過敏配方」的益生菌時，建議挑選「LP」+「LGG」+「A、B」菌，增加抗過敏菌株的定殖力，而非單一菌株的產品。
LGG乳酸菌：鼠李糖乳桿菌（Lactobacillus rhamnosus GG），根據芬蘭學者研究報告，服用LGG乳酸菌可降低50%寶寶在2歲前罹患異位性皮膚炎的機會，但會使寶寶得到氣喘的機率增加3倍、得到過敏性鼻炎的機率增加2倍。此類益生菌的作用，必須服用4-8周後才可能有改善的作用，並非像「改善腸道功能」的菌株，能在1-2周發揮作用。
三、腸道益生菌挑選原則
介紹過市面上常見腸道益生菌及各菌種的比較，那真的在購買保健食品時，常常有些誤導民眾的商業術語，到底要如何挑，才能選到合適的益生菌？以下提供一些觀念，幫助大家挑選商品：
1.菌種因地制宜，國外的菌種並不會較適合東方人
不同地區，人體腸道菌叢分部不同
旅行時所引起的水土不服，並不一定是吃了什麼壞掉的東西或是被細菌病毒感染的食品，很常是因為各國飲食習慣不同，導致不同地區，人體腸道菌叢分部不同，當我們原有的腸道環境，受到外來環境不同的刺激，進而影響腸道菌叢的作用，而產生腸道問題。
2.菌種愈多，不一定愈好，甚至有相互排斥的現象
能相輔相成的配合比較合適
(1) B. longum與L. paracasei（LP菌）所產生的廢物，是定殖在小腸中L. rhamnosus GG（LGG菌）的食物，可見其三者共生的重要性。
(2) 糞鏈球菌（S. faecalis）能快速在腸道分泌酸性物質，幫助嗜酸乳桿菌（L. acidophilus）及比菲德氏菌加速發育。
(3) 比較建議菌種為：A菌（L. acidophilus）、B菌（Bifidobacterium species）、C菌（Lactobacillus casei）、LGG菌（Lactobacillus rhamnosus GG）、LP菌（Lactobacillus paracasei）
3.菌數20億-100億為宜
腸道裡所能定殖的益生菌含量是有限的，過量的菌數，反而影響益生菌的作用。菌數過高，反而會造成菌株之間的相互卡位，無法發揮「各司其職」的功能。市售標謗含1000億菌株的產品，值得好好考慮其菌株定殖率。
4.劑型
膠囊、粉劑為宜。錠劑製作過時中，不可避免的會經過高熱的加壓而製成錠，而造成菌株的壞死。
5.益生菌偏寒
建議食用有增加溫性成分的複方益生菌，如冬蟲夏草（入腎）、紅景天（補肺），效果更佳。再者，過敏性患者體質偏寒，故不建議單吃益生菌。（此論點來自於「活力藥師網」，本人覺得其中醫角度切入過敏體質，中西合併的配方，值得參考。）
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